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TASSEL5.0中英文雙版使用說明書內(nèi)容介紹

全基因組關(guān)聯(lián)分析是利用遺傳標(biāo)記剖析復(fù)雜遺傳性狀的一種很熱門的方法。TASSEL軟件由康奈爾大學(xué)的Buckler實(shí)驗(yàn)室開發(fā)，它通過關(guān)聯(lián)、進(jìn)化和連鎖進(jìn)行性狀分析，利用最先進(jìn)的統(tǒng)計(jì)方法使找到QTL的統(tǒng)計(jì)功效最大化。TASSEL可以計(jì)算和圖示連鎖不平衡統(tǒng)計(jì)量。TASSEL的其他值得注意的特征包括一個(gè)序列比對(duì)瀏覽程序（sequence alignment viewer），從比對(duì)中抽出SNP和indel（插入和缺失），鄰接的進(jìn)化分枝圖（neighbor-joining cladogram）和許多數(shù)據(jù)圖示功能。TASSEL能把不同來源的數(shù)據(jù)合并到一個(gè)分析數(shù)據(jù)集中，用k最近鄰算法（k-nearest-neighbor algorithm）（COVER和HART 1967）估算缺失數(shù)據(jù)，并進(jìn)行主成分分析（PCA）來降低一套相關(guān)的表現(xiàn)型。TASSEL是用Java編寫的，因此它可以在任何操作系統(tǒng)下使用。